Thực hiện nhiệm vụ năm 2005 và kế hoạch công tác năm 2006, Ban Quản lý Dự án đã triển khai chỉ thị của GH, HVPGVN khóa V sẽ chuyển địa điểm tới huyện Sóc Sơn vào tháng 4 năm 2006. Ban Quản lý Dự án đã tiến hành xây dựng 4 tòa nhà lớn với tiêu chuẩn cao dành cho Tăng Ni sinh sinh hoạt, học tập với số lượng 400 vị.
Dự án xây dựng HVPGVN tại Hà Nội đã được Chính phủ quan tâm cấp 5 tỷ đồng vốn xây dựng cơ bản cùng với sự giúp đỡ của chư tôn đức trong HĐCM, HĐTS và Tăng Ni, Phật tử cả nước với số tiền hơn 1 tỷ đồng. Về khó khăn, địa điểm thi công đi lại xa trung tâm, nhân sự trong Ban Dự án ít, thiếu chuyên môn. Vốn để xây dựng còn thiếu hơn 20 tỷ đồng với thời gian hoàn thành quá gấp v.v…
Về công tác xây dựng cơ bản đã lập quy hoạch mặt bằng tổng thể HVPGVN, đã thi công 4 tòa nhà (3 tầng – 2 tầng) tổng diện tích mặt bằng 4.300m2 gồm ký túc xá, giảng đường, nhà ăn, thư viện. Hiện tại đã hoàn thành xong 2 tòa nhà, còn 2 tòa nhà đang tiếp tục hoàn thiện. Dự kiến sẽ hoàn thành việc chuyển Học viện vào tháng 4 năm 2006. Kế hoạch công tác năm 2006: hoàn thiện xây dựng Học viện theo đúng thời gian, tiếp tục xây dựng các hạng mục như quy hoạch tổng thể giải phóng mặt bằng, xây tường rào, thiết kế khu trung tâm, xây dựng cổng chính Học viện, thiết kế thi công lễ đài, hệ thống cấp thoát nước, bảo tàng Phật giáo, làm đường sá, trang bị vật dụng nội thất…